छोटे कोण एक्सरे बिखरने ( SAXS ) सुविधा Back

इस सुविधा में स्माल एंगिल एक्स-रे स्कैटरिंग (एसएएक्सएस) प्रणाली को उपलब्ध कराया गया है, इससे घोल में बृहदाणुओं के भौतिक एवं संरचनात्मक लक्षणों को डिसाइफर किया जाता है ।

स्माल एंगिल एक्स-रे स्कैटरिंग (एसएएक्सएस) एक ऐसी तकनीक है जिससे घोल में अणुओं के आकार, बनावट, क्वार्टरनरी संरचना एवं जटिल रचना का परीक्षण बिना क्रिस्टैलाईजेशन के होता है । इसमें संरचनात्मक मापदंड (गायरेशन की त्रिज्या (Rg), अधिकतम विमायें (Dmax), आंशिक-निर्दिष्ट आयतन (Vp) etc], अणुओं की गतिशीलता एवं अणुओं के लो-रिसोल्यूशन रचनाओं को भी उत्पन्न किया जाता है ।

सीसीएमबी में SAXS सुविधा S3-MICRO प्रणाली, Hecus एक्स-रे प्रणाली, GmbH है ।

  
परीक्षणात्मक व्यवस्था                :

  • Source power : 50 Watt

  • X-rays : Cu-Kα (λ=1.54 Å)

  • Beam Size at sample : 50 x 200 µm2

  • Photon flux : up to 2 x 108 photons/sec

  • Brilliance > 1010 (comaparable to that of a bending-magnet synchrotron SAXS beamlines)

  • Point focus at detector : monochromatic (Convergent beam <1 mrad)

  • Sample-detector distance : 300mm

  • Q-range : 0.003 to 0.6 Å-1 enables to cover a distance range of 2000 to 11 Å.

  • Pilatus 100k detector with a pixel size of 172*172 µm2.

  • SAXS Resolution range : 2000 Å to 30 Å.

SAXS नमूनों के लिए आवश्यकता       

  • Sample quality recommended : monodisperse macromolecule sample with buffer  (DLS,   Ultracentrifugation, gel analysis, etc.)

  • Concentration range : min. 1 mg/ml to max. 10 mg/ml
    [depends on the protein size; typically a concentration series (e.g. 1,2,3,5,10 mg/ml) has to be measured]

  • Buffer should contain minimum amount of additives.

  • Sample volume : 50-60 µl for a single SAXS measurement.

  • Temperature range : 10 ºC to 37 ºC.

  • Exposure time is 3600 s or 3000 s.

संपर्क :

वैज्ञानिक प्रभारी 
डॉ. राजन शंकरनारायणन sankar@ccmb.res.in Ph.: 27192832

तकनीकी प्रभारी 
सुश्री आर रूक्मिणी ruks@ccmb.res.in Ph: 27192953 (R-100, R & D); 27192835 (Lab, Main Building)
श्री के मल्लेशम malleshk@ccmb.res.in Ph:27192921


इंस्ट्रूमेंटेशन प्रभारी 
श्री वेंकटनारायण venkat@ccmb.res.in Ph : 27192591

SAXS-Lab [New R & D Structural Biology Facility] : Room:107 Ph.:27192919

प्रकाशन:

  1. Thakur AK, Srivastava AK, Srinivas V, Chary KV, & Rao CM (2011) Copper alters aggregation behavior of prion protein and induces novel interactions between its N- and C-terminal regions. J Biol Chem 286(44):38533-38545.

  2. Prabhu S, Srinivas V, Ramakrishna T, Raman B, & Rao Ch M (2011) Inhibition of Cu2+-mediated generation of reactive oxygen species by the small heat shock protein alphaB-crystallin: the relative contributions of the N- and C-terminal domains. Free Radic Biol Med 51(3):755-762.

  3. Arush Chhabra, Asfarul Haque S., Ravi Kant Pal, Aneesh Goyal, Rajkishore Rai, Seema Joshi, Santosh Panjikar, Santosh Pasha, Rajan Sankaranarayanan and Rajesh S. Gokhale (2012) Nonprocessive [2+2]e- Offloading Reductase Domains from Mycobacterial Non-ribosomal Peptide Synthetases Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 109 (15); 5681-5686.

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