CCMB

సియస్ఐఆర్ - కణ మరియు అణు జీవవిజ్ఞాన కేంద్రం

ది ఇన్నోవేషన్ ఇంజిన్ ఆఫ్ ఇండియా

×

దివ్య తేజ్ సౌపతి

దివ్య తేజ్ సౌపతి

దివ్య తేజ్ సౌపతి

శాస్త్రవేత్త
బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్, బిగ్ డేటా, జీవశాస్త్రంలో అల్గోరిథంలు
2862
tej[at]ccmb[dot]res[dot]in

పరిశోధన ఆసక్తులు
కణాలలో ఉండే DNA, సమిష్టిగా జీనోమ్ అని పిలుస్తారు, ఇది సెల్యులార్ యంత్రాలు జీవించడానికి మరియు పనిచేయడానికి చదివే సూచనల మాన్యువల్. 
భారతీయుల జన్యువులలోని వైవిధ్యం వారిని ఆరోగ్యం మరియు వ్యాధులలో అసమానతలకు ఎలా దారితీస్తుందో అర్థం చేసుకోవడంలో నా ప్రయోగశాల ఆసక్తి కలిగి ఉంది. 
మేము దీనిని రెండు స్థాయిలలో అధ్యయనం చేస్తాము.

మొదట, మేము అత్యాధునిక అధిక నిర్గమాంశ శ్రేణి సాంకేతికతలను ఉపయోగించి వ్యక్తుల జెనెటిక వేరియేషన్లను గుర్తిస్తాము. పెద్ద దేశవ్యాప్తంగా జనాభా జెనోమిక్స్ ప్రోగ్రాముల భాగంగా, మేము ఆరోగ్యమైన జెనోమ్స్‌లో సహజ వేరియేషన్లను మ్యాప్ చేస్తాము. ముఖ్యంగా, మా ఆసక్తులు రెండు వర్గాల వేరియేషన్లలో ఉంటాయి, అవి స్ట్రక్చరల్ వేరియేషన్లు మరియు టాండమ్ రిపీట్స్ గా అవుతాయి.

మేము అదే డిఎన్ఏ సీక్వెన్స్ ఎలా వేరు వేరు ఫినోటైప్‌లను సృష్టించగలదు అన్నదీ అధ్యయనం చేస్తున్నాము, ఇది ఒకే జీవి యొక్క వివిధ కణ రకాల్లో గమనించబడింది. ఒకే జెనోమ్ ఉన్నప్పటికీ, కణాలు ఎపిజెనెటిక్ పద్ధతుల ద్వారా భిన్నంగా నియంత్రించబడవచ్చు, ఇవి కణ స్పెసిఫిక్ జన్యు వ్యక్తీకరణ నమూనాలను ఫలితంగా తీసుకువస్తాయి. సింగిల్ సెల్ జెనోమిక్ సాంకేతికతలను ఉపయోగించి, వివిధ కణాల జన్యు వ్యక్తీకరణ మరియు ఎపిజెనెటిక్ ప్రొఫైల్స్‌ను విశ్లేషించి కణ విభిన్నతను అర్థం చేసుకుంటాము.

చివరగా, సంక్లిష్ట జీవ వైజ్ఞానిక డేటాను వేగంగా మరియు మెరుగ్గా విశ్లేషించడానికి, అలాగే మరింత పరస్పర మరియు సహజమైన డేటా విజువలైజేషన్‌ కోసం మేము కొత్త కంప్యూటేషనల్ పద్ధతులను అభివృద్ధి చేస్తున్నాము.

ఎంచుకున్న ప్రచురణలు (Selected Publications)

Pathak A.K., Mishra G.P., Uppili B., Walia S., Fatihi S., Abbas T., Banu S., Ghosh A., Kanampalliwar A., Jha A., Fatma S., Aggarwal S., Dhar M.S., Marwal R., Radhakrishnan V.S., Ponnusamy K., Kabra S., Rakshit P., Bhoyar R.C., Jain A., Divakar M.K., Imran M., Faruq M., Sowpati D.T., Thukral L., Raghav S.K., Mukerji M.
SARS-CoV-2 జీనోమ్స్‌లో హోస్ట్ లోపలి వైవిధ్యాల స్థల-కాల గమనికలు.
Nucleic Acids Research, 2022 ఫిబ్రవరి 22; 50(3):1551–1561.
doi: 10.1093/nar/gkab1297

Kumar V.J., Banu S., Sasikala M., Parsa K.V.L., Sowpati D.T., Yadav R., Tallapaka K.B., Siva A.B., Vishnubhotla R., Rao G.V., Reddy D.N.
SARS-CoV-2 యొక్క B.1.617.2 (డెల్టా) వేరియంట్‌పై REGEN-COV యాంటీబాడీ కాక్‌టెయిల్ ప్రభావశీలత: ఒక కోహోర్ట్ అధ్యయనం.
Journal of Internal Medicine, 2022 మార్చి; 291(3):380–383.
doi: 10.1111/joim.13408

Singh N.K., Srivastava S., Zaveri L., Bingi T.C., Mesipogu R., Kumar V.S., Gaur N., Hajirnis N., Machha P., Shambhavi S., Khan S., Soujanya M., Nagabandi T., Mishra R.K., Tallapaka K.B., Sowpati D.T.†
COVID-19 రోగుల్లో SARS-CoV-2 ఇన్ఫెక్షన్‌కు హోస్ట్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ ప్రతిస్పందన.
Clinical and Translational Medicine, 2021 సెప్టెంబర్; 11(9):e534.
doi: 10.1002/ctm2.534

Kulkarni O., Narreddy S., Zaveri L., Kalal I.G., Tallapaka K.B., Sowpati D.T.†
స్పైక్ ప్రోటీన్‌లో మార్పులు లేకుండా SARS-CoV-2 రీ-ఇన్ఫెక్షన్‌కు ఆధారాలు.
Clinical Infectious Diseases, 2021 ఫిబ్రవరి 16: ciab136.
doi: 10.1093/cid/ciab136

Banu S., Jolly B., Mukherjee P., Singh P., Khan S., Zaveri L., Shambhavi S., Gaur N., Reddy S., Kaveri K., Srinivasan S., Gopal D.R., Siva A.B., Thangaraj K., Tallapaka K.B., Mishra R.K., Scaria V., Sowpati D.T.†
భారతదేశంలోని SARS-CoV-2 ఐసోలేట్ల ప్రత్యేక ఫైలోజెనెటిక్ క్లస్టర్.
Open Forum Infectious Diseases, 2020 సెప్టెంబర్ 18; 7(11):ofaa434.
doi: 10.1093/ofid/ofaa434

Saha P., Sowpati D.T., Soujanya M., Srivastava I., Mishra R.K.
పెరిసెంట్రోమెరిక్ జీనోమ్ నిర్మాణం మరియు క్రోమాటిన్ ల్యాండ్‌స్కేప్ పరస్పర చర్యలు Drosophila melanogaster లోని హెటెరోక్రొమాటిక్ జీన్ల వ్యక్తీకరణను నియంత్రిస్తాయి.
Epigenetics & Chromatin, 2020 అక్టోబర్ 7; 13(1):41.
doi: 10.1186/s13072-020-00358-4

Avvaru A.K., Sharma D., Verma A., Mishra R.K., Sowpati D.T.
MSDB: మైక్రోశాటెలైట్‌లకు సంబంధించిన సమగ్రంగా వ్యాఖ్యానించిన డేటాబేస్.
Nucleic Acids Research, 2020 జనవరి 8; 48(D1):D155–D159.
doi: 10.1093/nar/gkz886

విద్య మరియు అనుభవం

P.G.:

జంతుశాస్త్రం; శ్రీ వెంకటేశ్వర విశ్వవిద్యాలయం, తిరుపతి; 2002

Ph.D:

హైదరాబాద్ విశ్వవిద్యాలయం/సెంటర్ ఫర్ DNA ఫింగర్ ప్రింటింగ్ అండ్ డయాగ్నస్టిక్స్, హైదరాబాద్; బయోకెమిస్ట్రీ; 2012

Post-doctoral Research:

రీసెర్చ్ అసోసియేట్; ఇండియన్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ టెక్నాలజీ, ఢిల్లీ; 2012 – 2013

రీసెర్చ్ అసోసియేట్, CSIR-CCMB ; 2013 – 2014 ;

ప్రాజెక్ట్ సైంటిస్ట్; CSIR-CCMB; 2014 – 2019

టీమ్ సభ్యులు

team-members-pic
Divya Tej Sowpati
Divya Tej Sowpati

Scientist-E

Scientist-E

Pratheusa Machha
Pratheusa Machha

Senior Research Fellow

Senior Research Fellow

Onkar Kulkarni
Onkar Kulkarni

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Nuthalapati Poojitha
Nuthalapati Poojitha

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Arvind Kumar
Arvind Kumar

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Sofia Banu
Sofia Banu

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Anukrati Sharma
Anukrati Sharma

Junior Research Fellow

Junior Research Fellow

Vanamamalai Venkata Krishna
Vanamamalai Venkata Krishna

Project Scientist-I

Project Scientist-I

Payel Mukherjee
Payel Mukherjee

Research Assistant

Research Assistant

Victor Bannerjee
Victor Bannerjee

Project Associate

Project Associate

Malini Nemalikanti
Malini Nemalikanti

Project Associate

Project Associate

Priya Singh
Priya Singh

Project Associate - I

Project Associate - I

Reuben Jacob Mathew
Reuben Jacob Mathew

Project Associate

Project Associate

Sreelekshmi M S
Sreelekshmi M S

Project Associate

Project Associate

Kottapalli Srividya
Kottapalli Srividya

Project Associate

Project Associate

Isha Choubey
Isha Choubey

Project Associate-I

Project Associate-I

ప్రచురణలు

శీర్షిక

పత్రిక

సంవత్సరం

Alcohol. 2021 Mar;91:29-38. doi: 10.1016/j.alcohol.2020.10.001. Epub 2020 Oct 8. PMID: 33038458.
2021
Stem Cell Rev Rep. 2021 Aug;17(4):1465-1477. doi: 10.1007/s12015-021-10136-8. Epub 2021 Feb 23. PMID: 33624208; PMCID: P
2021
J Biosci. 2021;46(1):22. doi: 10.1007/s12038-021-00145-7. PMID: 33737495; PMCID: PMC7895735.
2021
Nature. 2021 Sep 6. doi: 10.1038/s41586-021-03944-y. Epub ahead of print. PMID: 34488225.
2021
Clin Infect Dis. 2021 Sep 7;73(5):e1239-e1241. doi: 10.1093/cid/ciab136. PMID: 34492695; PMCID: PMC7929054.
2021
Clin Transl Med. 2021 Sep;11(9):e534. doi: 10.1002/ctm2.534. PMID: 34586723; PMCID: PMC8453261.
2021
Science. 2021 Oct 14:eabj9932. doi: 10.1126/science.abj9932. Epub ahead of print. PMID: 34648303.
2021
J Intern Med. 2021 Nov 1. doi: 10.1111/joim.13408. Epub ahead of print. PMID: 34719811.
2021
Epigenetics Chromatin. 2020 Oct 7;13(1):41. doi: 10.1186/s13072-020-00358-4. PMID: 33028366; PMCID: PMC7541242.
2020
Data Brief. 2020 Oct 21;33:106442. doi: 10.1016/j.dib.2020.106442. PMID: 33163595; PMCID: PMC7607250.
2020
Open Forum Infect Dis. 2020 Sep 18;7(11):ofaa434. doi: 10.1093/ofid/ofaa434. PMID: 33200080; PMCID: PMC7543508.
2020
G3 (Bethesda). 2020 May 4;10(5):1485-1494. doi: 10.1534/g3.120.401151. PMID: 32217632
2020
Nucleic Acids Res. 2020 Jan 8;48(D1):D155-D159. doi: 10.1093/nar/gkz886. PMID: 31599331
2020
Genomics. 2019 Mar;111(2):177-185. doi:10.1016/j.ygeno.2018.02.001. Epub 2018 Feb 10. PMID: 29432976.
2019
Epigenomics. 2019 Feb;11(3):251-266. doi: 10.2217/epi-2018-0060. Epub 2019 Jan 23. PMID: 30672333.
2019
BMC Genomics. 2019 Feb 22;20(1):153. doi: 10.1186/s12864-019-5516-5. PMID: 30795733;
2019
Bioinformatics. 2018 Mar 15;34(6):943-948. doi: 10.1093/bioinformatics/btx721. PMID: 29121165.
2018
Genome Biol Evol. 2017 Jun 1;9(6):1797-1802. doi: 10.1093/gbe/evx132. PMID: 28854643;
2017
BMC Bioinformatics. 2017 Sep 13;18(Suppl 10):392. doi:10.1186/s12859-017-1786-6. PMID: 28929968
2017
Sci Rep. 2016 Apr 26;6:25006. doi: 10.1038/srep25006. PMID: 27112593
2016
PLoS One. 2016 Nov 28;11(11):e0166854. doi: 10.1371/journal.pone.0166854. PMID: 27893794
2016
Int J Med Microbiol. 2015 May;305(3):322-6. doi: 10.1016/j.ijmm.2015.01.001. Epub 2015 Jan 13. PMID: 25648374.
2015
Mech Dev. 2015 Nov;138 Pt 2:97-112. doi: 10.1016/j.mod.2015.07.013. Epub 2015 Aug 7. PMID: 26259680.
2015
Genom Data. 2014 May 10;2:78-81. doi: 10.1016/j.gdata.2014.05.001. PMID: 26484075
2014
Mech Dev. 2008 Nov-Dec;125(11-12):963-73. doi: 10.1016/j.mod.2008.08.002. Epub 2008 Aug 28. PMID: 18789387.
2008

This will close in 0 seconds

Skip to content